Já que Orre possui poucos Pokémon selvagens, a maioria dos Pokémon disponíveis em Pokémon Colosseum terá que ser obtida com outros treinadores. Das 98 espécies presentes no jogo, 83 são Pokémon sombrios, 1 é a do inicial, 4 são obtidas por troca e apenas 9 aparecem como Pokémon selvagem.
Nenhum dos Pokémon disponíveis tem Nature ou IVs fixos, eles são gerados aleatoriamente.
Eevee
- Tipo:
- Nível 10
- Taxa de gênero: 87,5% macho 12,5% fêmea
- Moveset: Tackle, Tail Whip, Bite, Sand-Attack
- Experiência: 1250
- Pokémon inicial
- Observação: Um marinheiro no Parts Shop de Gateon Port dará o item necessário para a evolução, à escolha do jogador.
Pokémon sombrios
A captura e purificação dos Pokémons sombrios podem ser consideradas como o principal objetivo do jogo. Caso não consiga capturar determinado Pokémon sombrio nem desafiar novamente o treinador, o jogador poderá tentar capturar novamente o Pokémon sombrio através de Miror B., o qual pegará o Pokémon.
Teddiursa
- Tipo:
- Nível 11 ou +
- Taxa de gênero: 50% macho 50% fêmea
- Moveset: Shadow Blitz (Return), Shadow Mist (Refresh), Lick, Metal Claw
- Heart Gauge: 3000
- Localização: Pokémon HQ Lab
- Proprietário: Cipher Peon Naps
- Observação: Captura obrigatória
Ledyba
- Tipo:
- Nível 10 ou +
- Taxa de gênero: 50% macho 50% fêmea
- Moveset: Shadow Blitz (Psybeam), Shadow Shed (Refresh), Aerial Ace, Supersonic
- Heart Gauge: 2500
- Localização: Gateon Port
- Proprietário: Casual Guy Cyle
Poochyena
- Tipo:
- Nível 10 ou +
- Taxa de gênero: 50% macho 50% fêmea
- Moveset: Shadow Blitz (Dig), Shadow Hold (Heal Bell), Poison Fang, Howl
- Heart Gauge: 2500
- Localização: Gateon Port
- Proprietário: Bodybuilder Kilen
Houndour
- Tipo:
- Nível 17 ou +
- Taxa de gênero: 50% macho 50% fêmea
- Moveset: Shadow Blitz (Faint Attack), Shadow Shed (Charm), Ember, Roar
- Heart Gauge: 1500
- Localização: Cipher Lab
- Proprietário: Cipher Peon Resix
Spheal
- Tipo:
- Nível 17 ou +
- Taxa de gênero: 50% macho 50% fêmea
- Moveset: Shadow Wave (Aurora Beam), Shadow Mist (Charm), Water Gun, Mud-Slap
- Heart Gauge: 1500
- Localização: Cipher Lab
- Proprietário: Cipher Peon Blusix
Baltoy
- Tipo:
- Nível 17 ou +
- Taxa de gênero: Assexuado
- Moveset: Shadow Blitz (Rock Tomb), Shadow Mist (Refresh), Mud-Slap, Psybeam
- Heart Gauge: 1500
- Localização: Cipher Lab
- Proprietário: Cipher Peon Browsix
Mareep
- Tipo:
- Nível 17 ou +
- Taxa de gênero: 50% macho 50% fêmea
- Moveset: Shadow Blitz (Body Slam), Shadow Shed (Heal Bell), ThunderShock, Thunder Wave
- Heart Gauge: 1500
- Localização: Cipher Lab
- Proprietário: Cipher Peon Yellosix
Gulpin
- Tipo:
- Nível 17 ou +
- Taxa de gênero: 50% macho 50% fêmea
- Moveset: Shadow Blitz (Shock Wave), Shadow Hold (Sing), Sludge, Toxic
- Heart Gauge: 1500
- Localização: Cipher Lab
- Proprietário: Cipher Peon Purpsix
Seedot
- Tipo:
- Nível 17 ou +
- Taxa de gênero: 50% macho 50% fêmea
- Moveset: Shadow Wave (Giga Drain), Shadow Hold (Refresh), Bullet Seed, Secret Power
- Heart Gauge: 1500
- Localização: Cipher Lab
- Proprietário: Cipher Peon Greesix
Spinarak
- Tipo:
- Nível 14 ou +
- Taxa de gênero: 50% macho 50% fêmea
- Moveset: Shadow Blitz (Dig), Shadow Mist (Refresh), Signal Beam, Night Shade
- Heart Gauge: 1500
- Localização: Cipher Lab
- Proprietário: Cipher Peon Nexir
Numel
- Tipo:
- Nível 14 ou +
- Taxa de gênero: 50% macho 50% fêmea
- Moveset: Shadow Blitz (Take Down), Shadow Shed (Charm), Dig, Ember
- Heart Gauge: 1500
- Localização: Cipher Lab
- Proprietário: Cipher Peon Solox
Carvanha
- Tipo:
- Nível 15 ou +
- Taxa de gênero: 50% macho 50% fêmea
- Moveset: Shadow Blitz (Water Pulse), Shadow Hold (Refresh), Scary Face, Bite
- Heart Gauge: 1700
- Localização: Cipher Lab
- Proprietário: Cipher Peon Cabol
Shroomish
- Tipo:
- Nível 15 ou +
- Taxa de gênero: 50% macho 50% fêmea
- Moveset: Shadow Blitz (False Swipe), Shadow Mist (Refresh), Mega Drain, Stun Spore
- Heart Gauge: 1800
- Localização: Cipher Lab
- Proprietário: Cipher R&D Klots
Delcatty
- Tipo:
- Nível 18 ou +
- Taxa de gênero: 25% macho 75% fêmea
- Moveset: Shadow Rush (Secret Power), Shadow Wave (Sweet Kiss), Attract, Shock Wave
- Heart Gauge: 2500
- Localização: Cipher Lab
- Proprietário: Cipher Admin Lovrina
Voltorb
- Tipo:
- Nível 19 ou +
- Taxa de gênero: Assexuado
- Moveset: Shadow Rush (Mirror Coat), Shadow Panic (Refresh), Spark, Swift
- Heart Gauge: 2500
- Localização: Cave Poké Spot
- Proprietário: Wanderer Miror B.
Makuhita
- Tipo:
- Nível 18 ou +
- Taxa de gênero: 50% macho 50% fêmea
- Moveset: Shadow Blitz (Brick Break), Shadow Shed (Refresh), Arm Thrust, Rock Tomb
- Heart Gauge: 2000
- Localização: ONBS Building
- Proprietário: Cipher Peon Torkin
Vulpix
- Tipo:
- Nível 18 ou +
- Taxa de gênero: 50% macho 50% fêmea
- Moveset: Shadow Wave (Heat Wave), Shadow Hold (Charm), Ember, Dig
- Heart Gauge: 2000
- Localização: ONBS Building
- Proprietário: Cipher Peon Mesin
Duskull
- Tipo:
- Nível 19 ou +
- Taxa de gênero: 50% macho 50% fêmea
- Moveset: Shadow Wave (Shadow Ball), Shadow Hold (Helping Hand), Astonish, Confuse Ray
- Heart Gauge: 2200
- Localização: ONBS Building
- Proprietário: Cipher Peon Lobar
Ralts
- Tipo:
- Nível 20 ou +
- Taxa de gênero: 50% macho 50% fêmea
- Moveset: Shadow Wave (Shock Wave), Shadow Hold (Sing), Reflect, Confusion
- Heart Gauge: 2200
- Localização: ONBS Building
- Proprietário: Cipher Peon Feldas
Mawile
- Tipo:
- Nível 22 ou +
- Taxa de gênero: 50% macho 50% fêmea
- Moveset: Shadow Rush (False Swipe), Shadow Wave (Sing), ViceGrip, Iron Defense
- Heart Gauge: 2500
- Localização: ONBS Building
- Proprietário: Cipher Cmdr Exol
Snorunt
- Tipo:
- Nível 20 ou +
- Taxa de gênero: 50% macho 50% fêmea
- Moveset: Shadow Wave (Water Pulse), Shadow Shed (Sing), Bite, Icy Wind
- Heart Gauge: 2500
- Localização: Phenac City
- Proprietário: Cipher Peon Exinn
Pineco
- Tipo:
- Nível 20 ou +
- Taxa de gênero: 50% macho 50% fêmea
- Moveset: Shadow Blitz (Pin Missile), Shadow Shed (Refresh), Spikes, Counter
- Heart Gauge: 2500
- Localização: Phenac City
- Proprietário: Cipher Peon Gonrap
Natu
- Tipo:
- Nível 22 ou +
- Taxa de gênero: 50% macho 50% fêmea
- Moveset: Shadow Blitz (Future Sight), Shadow Shed (Baton Pass), Night Shade, Aerial Ace
- Heart Gauge: 2500
- Localização: Phenac City
- Proprietário: Cipher Peon Eloin
Roselia
- Tipo:
- Nível 22 ou +
- Taxa de gênero: 50% macho 50% fêmea
- Moveset: Shadow Wave (Magical Leaf), Shadow Shed (Sweet Kiss), GrassWhistle, Leech Seed
- Heart Gauge: 3000
- Localização: Phenac City
- Proprietário: Cipher Peon Fasin
Meowth
- Tipo:
- Nível 22 ou +
- Taxa de gênero: 50% macho 50% fêmea
- Moveset: Shadow Rush (Slash), Shadow Hold (Sing), Pay Day, Bite
- Heart Gauge: 3500
- Localização: Phenac City
- Proprietário: Cipher Peon Fostin
Swinub
- Tipo:
- Nível 22 ou +
- Taxa de gênero: 50% macho 50% fêmea
- Moveset: Shadow Blitz (Ancient Power), Shadow Wave (Charm), Mist, Mud Shot
- Heart Gauge: 2500
- Localização: Phenac City
- Proprietário: Cipher Peon Greck
Spearow
- Tipo:
- Nível 22 ou +
- Taxa de gênero: 50% macho 50% fêmea
- Moveset: Shadow Blitz (False Swipe), Shadow Panic (Baton Pass), Leer, Aerial Ace
- Heart Gauge: 4500
- Localização: Phenac City
- Proprietário: Cipher Peon Ezin
Grimer
- Tipo:
- Nível 23 ou +
- Taxa de gênero: 50% macho 50% fêmea
- Moveset: Shadow Blitz (Sludge Bomb), Shadow Hold (Helping Hand), Shadow Punch, Minimize
- Heart Gauge: 3000
- Localização: Phenac City
- Proprietário: Cipher Peon Faltly
Seel
- Tipo:
- Nível 23 ou +
- Taxa de gênero: 50% macho 50% fêmea
- Moveset: Shadow Wave (Surf), Shadow Mist (Helping Hand), Safeguard, Ice Beam
- Heart Gauge: 3500
- Localização: Phenac City
- Proprietário: Cipher Peon Egrog
Lunatone
- Tipo:
- Nível 25 ou +
- Taxa de gênero: Assexuado
- Moveset: Shadow Wave (Psychic), Shadow Shed (Baton Pass), Shadow Sky (Sunny Day), Rock Tomb
- Heart Gauge: 5000
- Localização: Phenac City
- Proprietário: Cipher Admin Snattle
Zangoose
- Tipo:
- Nível 28 ou +
- Taxa de gênero: 50% macho 50% fêmea
- Moveset: Shadow Rush (Brick Break), Shadow Mist (Refresh), Counter, Crush Claw
- Heart Gauge: 5000
- Localização: Cipher Key Lair
- Proprietário: Thug Zook
Nosepass
- Tipo:
- Nível 26 ou +
- Taxa de gênero: 50% macho 50% fêmea
- Moveset: Shadow Wave (Thunderbolt), Shadow Mist (Helping Hand), Thunder Wave, Rock Slide
- Heart Gauge: 4000
- Localização: Pyrite Colosseum/Realgam Colosseum/Poké Spots
- Proprietário: Wanderer Miror B.
Togepi
- Tipo:
- Nível 25 ou +
- Taxa de gênero: 87,5% macho 12,5% fêmea
- Moveset: Shadow Rave (Follow Me), Shadow Shed (Tri Attack), Ancient Power, Helping Hand
- Heart Gauge: 4500
- Localização: Outskirt Stand
- Proprietário: Pokémon Trainer Hordel
- Observação: Não precisa ser capturado, o cientista dará o Pokémon ao jogador
Paras
- Tipo:
- Nível 28 ou +
- Taxa de gênero: 50% macho 50% fêmea
- Moveset: Shadow Blitz (Spore), Shadow Shed (Refresh), Slash, False Swipe
- Heart Gauge: 4000
- Localização: Cipher Key Lair
- Proprietário: Cipher Peon Humah
Growlithe
- Tipo:
- Nível 28 ou +
- Taxa de gênero: 75% macho 25% fêmea
- Moveset: Shadow Blitz (Flamethrower), Shadow Wave (Charm), Bite, Take Down
- Heart Gauge: 4000
- Localização: Cipher Key Lair
- Proprietário: Cipher Peon Humah
Shellder
- Tipo:
- Nível 29 ou +
- Taxa de gênero: 50% macho 50% fêmea
- Moveset: Shadow Blitz (Take Down), Shadow Shed (Refresh), Surf, Aurora Beam
- Heart Gauge: 4000
- Localização: Cipher Key Lair
- Proprietário: Cipher Peon Gorog
Pidgeotto
- Tipo:
- Nível 30 ou +
- Taxa de gênero: 50% macho 50% fêmea
- Moveset: Shadow Blitz (Wing Attack), Shadow Panic (Refresh), Steel Wing, FeatherDance
- Heart Gauge: 4000
- Localização: Cipher Key Lair
- Proprietário: Cipher Peon Lok
Beedrill
- Tipo:
- Nível 30 ou +
- Taxa de gênero: 50% macho 50% fêmea
- Moveset: Shadow Blitz (Sludge Bomb), Shadow Hold (Baton Pass), Twineedle, Swords Dance
- Heart Gauge: 4500
- Localização: Cipher Key Lair
- Proprietário: Cipher Peon Lok
Tangela
- Tipo:
- Nível 30 ou +
- Taxa de gênero: 50% macho 50% fêmea
- Moveset: Shadow Rave (SolarBeam), Shadow Hold (Morning Sun), Sunny Day, Ingrain
- Heart Gauge: 4000
- Localização: Cipher Key Lair
- Proprietário: Cipher Peon Targ
Butterfree
- Tipo:
- Nível 30 ou +
- Taxa de gênero: 50% macho 50% fêmea
- Moveset: Shadow Rush (Psychic), Shadow Mist (Morning Sun), Sleep Powder, Aerial Ace
- Heart Gauge: 4000
- Localização: Cipher Key Lair
- Proprietário: Cipher Peon Targ
Magneton
- Tipo:
- Nível 30 ou +
- Taxa de gênero: Assexuado
- Moveset: Shadow Rave (Double-Edge), Shadow Hold (Refresh), Shadow Sky (Rain Dance), Thunder
- Heart Gauge: 4500
- Localização: Cipher Key Lair
- Proprietário: Cipher Peon Snidle
Venomoth
- Tipo:
- Nível 32 ou +
- Taxa de gênero: 50% macho 50% fêmea
- Moveset: Shadow Rush (Silver Wind), Shadow Mist (Refresh), Substitute, Psychic
- Heart Gauge: 4000
- Localização: Cipher Key Lair
- Proprietário: Cipher Peon Angic
Weepinbell
- Tipo:
- Nível 32 ou +
- Taxa de gênero: 50% macho 50% fêmea
- Moveset: Shadow Rave (Magical Leaf), Shadow Hold (Morning Sun), Sludge Bomb, Sweet Scent
- Heart Gauge: 4000
- Localização: Cipher Key Lair
- Proprietário: Cipher Peon Angic
Arbok
- Tipo:
- Nível 33 ou +
- Taxa de gênero: 50% macho 50% fêmea
- Moveset: Shadow Rush (Sludge Bomb), Shadow Half (Refresh), Glare, Bite
- Heart Gauge: 5000
- Localização: Cipher Key Lair
- Proprietário: Cipher Peon Smarton
Primeape
- Tipo:
- Nível 34 ou +
- Taxa de gênero: 50% macho 50% fêmea
- Moveset: Shadow Rush (Cross Chop), Shadow Storm (Helping Hand), Focus Energy, Reversal
- Heart Gauge: 6000
- Localização: Cipher Key Lair
- Proprietário: Cipher Admin Gorigan
Hypno
- Tipo:
- Nível 34 ou +
- Taxa de gênero: 50% macho 50% fêmea
- Moveset: Shadow Storm (Psychic), Shadow Down (Baton Pass), Meditate, Shadow Ball
- Heart Gauge: 5500
- Localização: Cipher Key Lair
- Proprietário: Cipher Admin Gorigan
Golduck
- Tipo:
- Nível 33 ou +
- Taxa de gênero: 50% macho 50% fêmea
- Moveset: Shadow Rave (Waterfall), Shadow Mist (Charm), Psych Up, Brick Break
- Heart Gauge: 6500
- Localização: Citadark Isle
- Proprietário: Navigator Abson
Sableye
- Tipo:
- Nível 33 ou +
- Taxa de gênero: 50% macho 50% fêmea
- Moveset: Shadow Blitz (Shadow Ball), Shadow Hold (Helping Hand), Faint Attack, Recover
- Heart Gauge: 7000
- Localização: Citadark Isle
- Proprietário: Navigator Abson
Raticate
- Tipo:
- Nível 34 ou +
- Taxa de gênero: 50% macho 50% fêmea
- Moveset: Shadow Rush (Super Fang), Shadow Down (Refresh), Scary Face, Hyper Fang
- Heart Gauge: 6000
- Localização: Citadark Isle
- Proprietário: Chaser Furgy
Dodrio
- Tipo:
- Nível 34 ou +
- Taxa de gênero: 50% macho 50% fêmea
- Moveset: Shadow Blitz (Drill Peck), Shadow Shed (Baton Pass), Agility, Tri Attack
- Heart Gauge: 8000
- Localização: Citadark Isle
- Proprietário: Chaser Furgy
Farfetch'd
- Tipo:
- Nível 36 ou +
- Taxa de gênero: 50% macho 50% fêmea
- Moveset: Shadow Break (Slash), Shadow Sky (Baton Pass), Shadow Panic (Swords Dance), Aerial Ace
- Heart Gauge: 5500
- Localização: Citadark Isle
- Proprietário: Cipher Admin Lovrina
Altaria
- Tipo:
- Nível 36 ou +
- Taxa de gênero: 50% macho 50% fêmea
- Moveset: Shadow Break (DragonBreath), Shadow Mist (Heal Bell), Shadow Rave (SolarBeam), Aerial Ace
- Heart Gauge: 6500
- Localização: Citadark Isle
- Proprietário: Cipher Admin Lovrina
Kangaskhan
- Tipo:
- Nível 35 ou +
- Taxa de gênero: 0% macho 100% fêmea
- Moveset: Shadow Rush (Earthquake), Shadow Mist (Sing), Tail Whip, Dizzy Punch
- Heart Gauge: 6000
- Localização: Citadark Isle
- Proprietário: Cipher Peon Litnar
Banette
- Tipo:
- Nível 37 ou +
- Taxa de gênero: 50% macho 50% fêmea
- Moveset: Shadow Rush (Faint Attack), Shadow Hold (Helping Hand), Shadow Ball, Curse
- Heart Gauge: 7000
- Localização: Citadark Isle
- Proprietário: Cipher Peon Litnar
Magmar
- Tipo:
- Nível 36 ou +
- Taxa de gênero: 75% macho 25% fêmea
- Moveset: Shadow Rave (Fire Blast), Shadow Rush (Follow Me), Shadow Shed (Cross Chop), ThunderPunch
- Heart Gauge: 7000
- Localização: Citadark Isle
- Proprietário: Cipher Peon Grupel
Pinsir
- Tipo:
- Nível 35 ou +
- Taxa de gênero: 50% macho 50% fêmea
- Moveset: Shadow Break (Guillotine), Shadow Shed (Helping Hand), False Swipe, Submission
- Heart Gauge: 7000
- Localização: Citadark Isle
- Proprietário: Cipher Peon Grupel
Magcargo
- Tipo:
- Nível 38 ou +
- Taxa de gênero: 50% macho 50% fêmea
- Moveset: Shadow Rave (Heat Wave), Shadow Shed (Refresh), Earthquake, Flamethrower
- Heart Gauge: 5500
- Localização: Citadark Isle
- Proprietário: Cipher Peon Kolest
Rapidash
- Tipo:
- Nível 40 ou +
- Taxa de gênero: 50% macho 50% fêmea
- Moveset: Shadow Rave (SolarBeam), Shadow Down (Baton Pass), Shadow Sky (Sunny Day), Flamethrower
- Heart Gauge: 6000
- Localização: Citadark Isle
- Proprietário: Cipher Peon Kolest
Hitmonchan
- Tipo:
- Nível 38 ou +
- Taxa de gênero: 100% macho 0% fêmea
- Moveset: Shadow Rush (Mega Punch), Shadow Down (Helping Hand), Mind Reader, Sky Uppercut
- Heart Gauge: 6000
- Localização: Citadark Isle
- Proprietário: Cipher Peon Karbon
Hitmonlee
- Tipo:
- Nível 38 ou +
- Taxa de gênero: 100% macho 0% fêmea
- Moveset: Shadow Rush (Hi Jump Kick), Shadow Down (Refresh), Shadow Half (Mind Reader), Mega Kick
- Heart Gauge: 7000
- Localização: Citadark Isle
- Proprietário: Cipher Peon Petro
Lickitung
- Tipo:
- Nível 38 ou +
- Taxa de gênero: 50% macho 50% fêmea
- Moveset: Shadow Rush (Double-Edge), Shadow Panic (Helping Hand), Defense Curl, Rollout
- Heart Gauge: 5000
- Localização: Citadark Isle
- Proprietário: Cipher Peon Geftal
Scyther
- Tipo:
- Nível 40 ou +
- Taxa de gênero: 50% macho 50% fêmea
- Moveset: Shadow Rush (Razor Wind), Shadow Mist (Morning Sun), Silver Wind, Slash
- Heart Gauge: 8000
- Localização: Citadark Isle
- Proprietário: Cipher Peon Leden
Chansey
- Tipo:
- Nível 39 ou +
- Taxa de gênero: 0% macho 100% fêmea
- Moveset: Shadow Rave (Thunderbolt), Shadow Hold (Sweet Kiss), Softboiled, Skill Swap
- Heart Gauge: 4000
- Localização: Citadark Isle
- Proprietário: Cipher Peon Leden
Solrock
- Tipo:
- Nível 41 ou +
- Taxa de gênero: Assexuado
- Moveset: Shadow Rave (Psychic), Shadow Panic (Baton Pass), Shadow Sky (Sunny Day), Cosmic Power
- Heart Gauge: 7500
- Localização: Citadark Isle
- Proprietário: Cipher Admin Snattle
Starmie
- Tipo:
- Nível 41 ou +
- Taxa de gênero: Assexuado
- Moveset: Shadow Storm (Waterfall), Shadow Break (Refresh), Shadow Mist (Ice Beam), Recover
- Heart Gauge: 7500
- Localização: Citadark Isle
- Proprietário: Cipher Admin Snattle
Electabuzz
- Tipo:
- Nível 43 ou +
- Taxa de gênero: 75% macho 25% fêmea
- Moveset: Shadow Break (Cross Chop), Shadow Mist (Follow Me), Shadow Half (Thunder Wave), Shadow Storm (Thunderbolt)
- Heart Gauge: 7000
- Localização: Citadark Isle
- Proprietário: Cipher Admin Ardos
Swellow
- Tipo:
- Nível 43 ou +
- Taxa de gênero: 50% macho 50% fêmea
- Moveset: Shadow Break (Sky Attack), Shadow Sky (Baton Pass), Shadow Half (Agility), Shadow Mist (Facade)
- Heart Gauge: 7000
- Localização: Citadark Isle
- Proprietário: Cipher Admin Ardos
Snorlax
- Tipo:
- Nível 43 ou +
- Taxa de gênero: 87,5% macho 12,5% fêmea
- Moveset: Shadow End (Fissure), Shadow Shed (Refresh), Curse, Body Slam
- Heart Gauge: 9000
- Localização: Citadark Isle
- Proprietário: Cipher Admin Ardos
Poliwrath
- Tipo:
- Nível 42 ou +
- Taxa de gênero: 50% macho 50% fêmea
- Moveset: Shadow Storm (Hydro Pump), Shadow Rush (Helping Hand), Shadow Sky (Rain Dance), Brick Break
- Heart Gauge: 7500
- Localização: Citadark Isle
- Proprietário: Cipher Admin Gorigan
Mr. Mime
- Tipo:
- Nível 42 ou +
- Taxa de gênero: 50% macho 50% fêmea
- Moveset: Shadow Storm (Psychic), Shadow Shed (Follow Me), Encore, ThunderPunch
- Heart Gauge: 6500
- Localização: Citadark Isle
- Proprietário: Cipher Admin Gorigan
Dugtrio
- Tipo:
- Nível 40 ou +
- Taxa de gênero: 50% macho 50% fêmea
- Moveset: Shadow Break (Earthquake), Shadow Shed (Charm), Shadow Sky (Sandstorm), Tri Attack
- Heart Gauge: 5000
- Localização: Citadark Isle
- Proprietário: Cipher Peon Kolax
Manectric
- Tipo:
- Nível 44 ou +
- Taxa de gênero: 50% macho 50% fêmea
- Moveset: Shadow End (Thunder), Shadow Mist (Refresh), Shadow Sky (Rain Dance), Bite
- Heart Gauge: 7000
- Localização: Citadark Isle
- Proprietário: Cipher Admin Eldes
Salamence
- Tipo:
- Nível 50 ou +
- Taxa de gênero: 50% macho 50% fêmea
- Moveset: Shadow Rush (Dragon Claw), Shadow Hold (Refresh), Dragon Dance, Aerial Ace
- Heart Gauge: 9000
- Localização: Citadark Isle
- Proprietário: Cipher Admin Eldes
Marowak
- Tipo:
- Nível 44 ou +
- Taxa de gênero: 50% macho 50% fêmea
- Moveset: Shadow End (Earthquake), Shadow Panic (Sing), Swords Dance, Rock Slide
- Heart Gauge: 6500
- Localização: Citadark Isle
- Proprietário: Cipher Admin Eldes
Lapras
- Tipo:
- Nível 44 ou +
- Taxa de gênero: 50% macho 50% fêmea
- Moveset: Shadow Storm (Hydro Pump), Shadow Shed (Heal Bell), Shadow Sky (Rain Dance), Blizzard
- Heart Gauge: 6000
- Localização: Citadark Isle
- Proprietário: Cipher Admin Eldes
Lugia
- Tipo:
- Nível 50 ou +
- Taxa de gênero: Assexuado
- Moveset: Shadow Blast (Psycho Boost), Shadow Shed (FeatherDance), Shadow Down (Earthquake), Shadow Storm (Hydro Pump)
- Heart Gauge: 13000
- Localização: Citadark Isle
- Proprietário: Grand Master Greevil
- Observação: Captura obrigatória. Só pode ser purificado usando todos os slots da Purification Chamber
Moltres
- Tipo:
- Nível 50 ou +
- Taxa de gênero: Assexuado
- Moveset: Shadow Fire (Extrasensory), Shadow Shed (Morning Sun), Shadow Hold (Will-O-Wisp), Shadow Rush (Flamethrower)
- Heart Gauge: 10000
- Localização: Citadark Isle
- Proprietário: Grand Master Greevil
Zapdos
- Tipo:
- Nível 50 ou +
- Taxa de gênero: Assexuado
- Moveset: Shadow Bolt (Extrasensory), Shadow Shed (Baton Pass), Shadow Sky (Metal Sound), Shadow Rush (Thunderbolt)
- Heart Gauge: 10000
- Localização: Citadark Isle
- Proprietário: Grand Master Greevil
Articuno
- Tipo:
- Nível 50 ou +
- Taxa de gênero: Assexuado
- Moveset: Shadow Chill (Extrasensory), Shadow Shed (Heal Bell), Shadow Sky (Haze), Shadow Rush (Ice Beam)
- Heart Gauge: 10000
- Localização: Citadark Isle
- Proprietário: Grand Master Greevil
Tauros
- Tipo:
- Nível 46 ou +
- Taxa de gênero: 100% macho 0% fêmea
- Moveset: Shadow Rush (Earthquake), Shadow Hold (Refresh), Shadow Shed (Tail Whip), Shadow Sky (Body Slam)
- Heart Gauge: 9000
- Localização: Citadark Isle
- Proprietário: Grand Master Greevil
Rhydon
- Tipo:
- Nível 46 ou +
- Taxa de gênero: 50% macho 50% fêmea
- Moveset: Shadow End (Megahorn), Shadow Down (Helping Hand), Shadow Panic (Scary Face), Shadow Hold (Earthquake)
- Heart Gauge: 7000
- Localização: Citadark Isle
- Proprietário: Grand Master Greevil
Exeggutor
- Tipo:
- Nível 46 ou +
- Taxa de gênero: 50% macho 50% fêmea
- Moveset: Shadow Storm (Psychic), Shadow Shed (Refresh), Shadow Hold (Hypnosis), Shadow End (Ancient Power)
- Heart Gauge: 9000
- Localização: Citadark Isle
- Proprietário: Grand Master Greevil
Dragonite
- Tipo:
- Nível 55 ou +
- Taxa de gênero: 50% macho 50% fêmea
- Moveset: Shadow Rush (Hyper Beam), Shadow Down (Heal Bell), Shadow Shed (Dragon Dance), Shadow Storm (Earthquake)
- Heart Gauge: 9000
- Localização: Gateon Port
- Proprietário: Wanderer Miror B.
- Observação: Disponível somente após todos os demais Pokémon sombrios serem capturados.
Pokémon selvagens
Após "participar" da entrevista de Duking em Pyrite Town, o jogador poderá encontrar Pokémon selvagens em pontos específicos de Orre, caso deixe uma "isca" (Poké Snack) no local e volte depois. Poké Snacks podem ser comprados em qualquer mercado da região, e o PDA do jogador o avisará caso um Pokémon se aproxime do local. Caso o protagonista demore muito para se deslocar até lá, o Pokémon vai consumir a "isca" e fugir.
Sandshrew
- Tipo:
- Nível: de 10 até 23
- Taxa de gênero: 50% macho 50% fêmea
- Raridade: Comum (50% de chance)
- Localização: Rock Poké Spot
Gligar
- Tipo:
- Nível: de 10 até 20
- Taxa de gênero: 50% macho 50% fêmea
- Raridade: Incomum (35% de chance)
- Localização: Rock Poké Spot
Trapinch
- Tipo:
- Nível: de 10 até 20
- Taxa de gênero: 50% macho 50% fêmea
- Raridade: Raro (15% de chance)
- Localização: Rock Poké Spot
Hoppip
- Tipo:
- Nível: de 10 até 20
- Taxa de gênero: 50% macho 50% fêmea
- Raridade: Comum (50% de chance)
- Localização: Oasis Poké Spot
Phanpy
- Tipo:
- Nível: de 10 até 20
- Taxa de gênero: 50% macho 50% fêmea
- Raridade: Incomum (35% de chance)
- Localização: Oasis Poké Spot
Surskit
- Tipo:
- Nível: de 10 até 20
- Taxa de gênero: 50% macho 50% fêmea
- Raridade: Raro (15% de chance)
- Localização: Oasis Poké Spot
Zubat
- Tipo:
- Nível: de 10 até 21
- Taxa de gênero: 50% macho 50% fêmea
- Raridade: Comum (50% de chance)
- Localização: Cave Poké Spot
Aron
- Tipo:
- Nível: de 10 até 21
- Taxa de gênero: 50% macho 50% fêmea
- Raridade: Incomum (35% de chance)
- Localização: Cave Poké Spot
Wooper
- Tipo:
- Nível: de 10 até 21
- Taxa de gênero: 50% macho 50% fêmea
- Raridade: Raro (15% de chance)
- Localização: Cave Poké Spot
Trocas in-game
A troca com Hordel tem uma peculiaridade: se o jogador oferer o Togetic purificado, o cientista dará em troca um Elekid com o moveset Cross Chop / Fire Punch / Ice Punch / ThunderPunch, o qual é incomum.
Mas se o jogador oferecer um Togetic purificado ou outro Togepi, Hordel dará em troca um Elekid comum, com o moveset esperado para seu nível. Caso o protagonista se recuse a devolver o Togepi (ou Togetic) por troca, Hordel dirá que entende a escolha do jogador e pedirá que ele cuide bem do Pokémon.
Local |
Interessado |
|
|
|
Troca |
|
Outskirt Stand |
Hordel | |
|
Elekid* |
por |
Togepi |
Pyrite Town |
Duking | |
|
Meditite |
por |
Trapinch |
Pyrite Town |
Duking | |
|
Shuckle |
por |
Surskit |
Pyrite Town |
Duking | |
|
Larvitar |
por |
Wooper |
* Créditos das imagens: xxxsak-hi.deviantart.com (banner), sprites do jogo.